Em Evangelion: 2.0 You Can (Not) Advance, Shinji tenta se adaptar à vida em Tóquio 3 enquanto pilota o EVA 01 contra novos Anjos cada vez mais destrutivos. A chegada de Asuka e da misteriosa piloto Mari altera a dinâmica entre os personagens e intensifica os conflitos emocionais. Misato e a NERV escondem segredos ligados ao Impacto e ao verdadeiro propósito dos EVAs. Entre batalhas devastadoras e escolhas dolorosas, Shinji é forçado a decidir até onde está disposto a ir para proteger aqueles que ama.