Lelouch assume a identidade de Zero e lidera a Ordem dos Cavaleiros Negros contra o Império da Britannia, enquanto o mundo mergulha em guerra total. Com o poder do Geass e alianças frágeis, ele enfrenta antigos amigos e novos inimigos em uma batalha estratégica decisiva. O conflito atinge seu auge quando Lelouch precisa escolher entre sua vingança pessoal e a criação de um novo mundo para Nunnally e todos os oprimidos.