Na continuação de Vandread a Segunda Fase acompanha Hibiki e a tripulação da Nirvana após descobrirem a verdadeira ameaça por trás da guerra entre homens e mulheres. Agora mais unidos eles enfrentam inimigos ainda mais poderosos enquanto aprofundam laços pessoais e questionam preconceitos antigos. Novos mistérios sobre a origem da humanidade surgem e a tripulação precisa decidir o futuro de ambos os mundos em batalhas espaciais intensas cheias de ação humor e romance.
