Em um futuro em que 99 por cento da humanidade foi exterminada por invasores alienígenas chamados Dracters, a Terra foi remodelada e os sobreviventes vivem em cidades protegidas, sem lembrar da tragédia. Alguns jovens escolhidos recuperam suas memórias e são recrutados para pilotar o robô gigante Musashi, formado pela combinação de três mechas. Enquanto lutam para defender o planeta e descobrir a verdade sobre a invasão, eles enfrentam conflitos pessoais, segredos governamentais e o peso de serem a última linha de defesa da humanidade.