Os especiais de Genshiken Nidaime acompanham momentos extras do cotidiano do clube de estudos da cultura visual moderna. Focam em situações cômicas e descontraídas que aprofundam as relações entre os membros otaku do grupo. Entre conversas sobre anime e mangá eventos e pequenas confusões do dia a dia os episódios mostram bastidores e cenas paralelas à série principal reforçando o humor e o clima leve da obra.