Kitarou embarca em um misterioso trem fantasma que surge apenas durante a noite, ligando o mundo humano ao reino dos youkai. Ao investigar o aparecimento do trem e o desaparecimento de passageiros, ele descobre um plano sombrio que ameaça o equilíbrio entre vivos e espíritos. Com a ajuda de seus aliados youkai, Kitarou enfrenta criaturas sobrenaturais e armadilhas espirituais dentro dos vagões assombrados, buscando salvar as vítimas e impedir que o trem continue sua jornada de terror.