Em Soukyuu no Fafner: Dead Aggressor Heaven and Earth, dois anos após a batalha contra os Festum, a ilha Tatsumiyajima vive uma paz frágil. Kazuki e seus amigos tentam seguir em frente enquanto lidam com perdas e traumas. A aparição de um misterioso garoto ligado aos Festum reacende conflitos e dúvidas sobre o futuro da humanidade. Entre novos combates e revelações, os pilotos de Fafner precisam decidir até onde irão para proteger a coexistência entre humanos e Festum, enfrentando escolhas dolorosas e um destino incerto.
