Com o avanço pesado da tecnologia cibernética e da inteligência artificial no começo do século XXI, os seres humanos passam a mexer no próprio corpo até o talo, a ponto de o mundo ficar irreconhecível. Em 2029, a metrópole japonesa de Newport City vira um baita palco pra criminoso que se aproveita dessas tecnologias de ponta pra ganhar em cima dos outros e agarrar poder de qualquer jeito, custe o que custar.
Depois de construir uma boa reputação e receber sinal verde da Segurança Pública, a determinada Motoko Kusanagi assume o comando de uma nova unidade de forças especiais. No meio desse cenário caótico, ela e sua equipe encaram casos pesados de crime cibernético que a polícia comum não teria a menor condição de resolver. Só que, mesmo com um histórico de operações bem-sucedidas, Kusanagi e seu time logo percebem que talvez exista uma mente por trás do pano, um articulador escorregadio cujas ações balançam ainda mais o frágil equilíbrio da cidade, como se Newport City estivesse andando na corda bamba sobre um abismo.