Apesar de ter crescido sem pai nem mãe, Nio Chirinu acaba encontrando um cantinho pra chamar de seu: trabalha como garçom no restaurante da avó adotiva, e ali ele sente que finalmente faz parte de uma família. Só que essa calmaria não dura muito. Nio e a irmã, Iroha, acabam sendo usados como isca pra capturar sequestradores de crianças por Toshizou Hijikata e Souji Okita, dois caras ligados a um famoso grupo de ronins chamado Miburo. Depois desse sufoco, Toshizou faz uma proposta tentadora: quer que Nio entre pro Miburo e ajude a proteger o povo de Kyoto.

Incomodado com a própria fraqueza, Nio se joga de cabeça nos treinos pra tentar alcançar o nível de espada dos novos companheiros. Mesmo assim, ele penando pra ser aceito por Tarou Tanaka e Hajime Saitou, os outros membros do Miburo que têm mais ou menos a mesma idade que ele. Decidido a virar amigo deles, Nio precisa descobrir qual é o próprio senso de justiça e criar força suficiente pra encarar qualquer inimigo que apareça no caminho, como se tivesse que forjar a si mesmo no fogo das batalhas.