Kure-nai segue a história de Shinkurou Kurenai, um mediador profissional que resolve disputas entre pessoas. Sua vida muda drasticamente quando ele é designado para proteger Murasaki Kuhouin, uma jovem garota de uma família poderosa. Apesar de sua aparência frágil, Murasaki possui uma personalidade forte e não se conforma facilmente com as normas restritivas de sua família. Juntos, Shinkurou e Murasaki enfrentam diversos desafios, enquanto ele tenta mantê-la segura de perigos e ensina-a sobre o mundo exterior, longe do isolamento e das regras rígidas de sua família. A história explora temas de família, sociedade e crescimento pessoal.