Em um futuro próximo a Terra é invadida pelos alienígenas Ganymedes que destroem grande parte das defesas humanas. Para enfrentar a ameaça o cientista Shikishima cria o robô gigante Mechander Robo operado por três jovens pilotos. Eles lutam em batalhas intensas contra monstros mecânicos e armas colossais enquanto tentam proteger o planeta e descobrir os segredos por trás da invasão.