Goemon é um jovem ladrão de bom coração que vive aventuras cômicas em um Japão fantástico repleto de tecnologia estranha e criaturas bizarras. Ao lado de seus amigos Ebisumaru, Sasuke e Yae, ele enfrenta vilões excêntricos que ameaçam a paz do país. Misturando humor, ação e elementos folclóricos, a história acompanha o grupo viajando por cidades coloridas, templos misteriosos e castelos cheios de armadilhas. Cada episódio traz planos malucos dos inimigos e invenções absurdas, enquanto Goemon usa sua coragem e seu famoso cachimbo de ferro para proteger as pessoas e buscar justiça.