Em um futuro em que um asteroide ameaça destruir a Terra, a organização ISDA desenvolve dragões humanos para combatê lo. Jin Kamishina, único sobrevivente de um desastre espacial, conhece Toa, uma misteriosa garota ligada aos dragões. Envolvido em conspirações, Jin descobre segredos sobre o projeto Dragonaut e sobre seu próprio passado. Entre batalhas espaciais, alianças frágeis e laços emocionais intensos, humanos e dragões lutam para proteger o planeta e decidir o destino da humanidade.