Shion no Ou segue a história de Yasuoka Shion, uma jovem jogadora de shogi (xadrez japonês) cujos pais foram brutalmente assassinados quando ela tinha apenas 4 anos. A tragédia a deixou muda, mas não tirou sua paixão e talento pelo shogi. O único elo com o assassino é um peão de shogi deixado na cena do crime, levando Shion a buscar vingança através do jogo. Enquanto ela compete em torneios de shogi, a verdade sobre o assassinato de seus pais começa a se desvendar, envolvendo-a em mistérios e desafios tanto no tabuleiro quanto na vida.