Natsunagu! acompanha Natsuna, uma universitária de Tóquio que perde contato com sua amiga de infância após o terremoto em Kumamoto. Preocupada, ela viaja até a região para encontrá la. Lá conhece moradores locais, faz novas amizades e descobre histórias de superação enquanto procura pistas sobre o paradeiro da amiga. A jornada revela a força dos laços humanos e o impacto da reconstrução após o desastre.