Em Kamihama, garotas mágicas são atraídas por uma força misteriosa que promete salvá-las de seus destinos trágicos. Iroha Tamaki chega à cidade em busca de sua irmã desaparecida e descobre segredos sombrios por trás dos contratos com Kyubey. Enquanto enfrenta bruxas cada vez mais perigosas, ela encontra outras garotas mágicas com passados dolorosos e objetivos conflitantes. Juntas, tentam desvendar o enigma da cidade e o verdadeiro preço de seus poderes, enquanto o encontro com Madoka e Homura aproxima duas histórias marcadas por sacrifícios e desejos distorcidos.