Em um mundo alternativo em guerra contra misteriosas criaturas chamadas Neuroi, jovens garotas com poderes mágicos integram a unidade aérea 501. Vivendo juntas em uma base, elas enfrentam missões perigosas enquanto lidam com o cotidiano cheio de confusões, treinamentos atrapalhados e momentos cômicos. A série mostra o lado leve e bem humorado das Strike Witches, destacando a convivência entre personalidades diferentes, amizades e pequenos desafios diários.