Black Jack 21 acompanha o genial cirurgião sem licença Black Jack em uma nova série de casos médicos extremos enquanto ele busca respostas sobre seu passado. Envolvido em uma conspiração global que envolve pesquisas secretas e poderosas organizações, ele viaja pelo mundo enfrentando doenças raras, dilemas éticos e inimigos perigosos. Ao lado de Pinoko, sua peculiar assistente, Black Jack precisa decidir até onde irá para salvar vidas e descobrir a verdade sobre sua origem e sobre o projeto misterioso que marcou sua infância.
