Takuya Arima recebe de seu pai desaparecido um misterioso dispositivo capaz de viajar entre realidades paralelas. Ao investigar o sumiço do pai e estranhos fenômenos em sua cidade litorânea, ele conhece a enigmática Yu no e várias garotas ligadas a segredos do tempo e do espaço. Cada escolha de Takuya altera o rumo dos acontecimentos, revelando conspirações, tragédias e verdades sobre mundos alternativos. Entre laços afetivos e dilemas morais, ele precisa descobrir qual realidade salvar e qual sacrifício aceitar para proteger aqueles que ama.