Em Green Green, um colégio masculino isolado recebe, em caráter experimental, um grupo de alunas transferidas. A convivência repentina entre garotos imaturos e garotas curiosas gera situações cômicas, mal-entendidos românticos e muitos constrangimentos. Entre brincadeiras exageradas e paixões adolescentes, um misterioso laço do passado parece unir o protagonista e uma das novas alunas, trazendo à tona memórias esquecidas e sentimentos intensos.