Ange Vierge segue a história de meninas que despertam poderes mágicos após um fenômeno misterioso que conecta mundos diferentes. Estas meninas, conhecidas como Progress, são levadas para uma escola especial em uma ilha isolada, a Seiran Island, onde devem aprender a controlar suas novas habilidades e trabalhar juntas para enfrentar ameaças que surgem dos portais conectando os mundos. Com o destino dos mundos em jogo, essas jovens guerreiras devem superar suas diferenças e aprender o verdadeiro significado de amizade e coragem para proteger tudo o que amam.