Nijiiro Days acompanha quatro amigos do ensino médio Natsuki, Tomoya, Keiichi e Tsuyoshi em seu cotidiano cheio de paixões, inseguranças e amizade. Natsuki é romântico e se apaixona por Anna, uma garota tímida de sua escola. Enquanto ele tenta se aproximar dela, seus amigos interferem com conselhos duvidosos e situações engraçadas. A história mostra primeiros amores, ciúmes e amadurecimento de forma leve e divertida, destacando os laços entre amigos e os desafios da adolescência.