Em uma ilha de pesquisa isolada, o professor universitário Saikawa e a brilhante estudante Nishinosono visitam um laboratório de tecnologia avançada. Lá, conhecem a enigmática doutora Magata, gênio recluso que vive trancada em um quarto há anos. Quando um assassinato impossível ocorre em ambiente totalmente controlado, o local entra em confinamento. Sem poder escapar, Saikawa e Nishinosono precisam desvendar o mistério por trás do crime, da vida de Magata e de uma série de enigmas lógicos que desafiam a razão. Tudo converge para uma única pista enigmática: a letra F.