Honey Kisaragi é uma estudante aparentemente comum que descobre ser um androide criado por seu pai cientista. Após o assassinato dele pela organização criminosa Panther Claw, ela decide lutar pela justiça usando o dispositivo Airborne Element Fixing Device que lhe permite transformar seu corpo em diversas formas de guerreira. Como Cutie Honey ela enfrenta inimigos extravagantes, protege inocentes e busca vingança pela morte do pai enquanto equilibra sua vida escolar e sua verdadeira identidade heroica em um mundo cheio de ação, humor e toques de romance.