Sousuke Sagara é um jovem soldado criado em campos de batalha que recebe a missão de proteger Kaname Chidori, uma estudante do ensino médio com um segredo valioso. Para isso ele precisa se infiltrar na escola e agir como um aluno comum, algo em que não tem nenhuma experiência. Enquanto tenta se adaptar à vida civil, Sousuke enfrenta organizações terroristas, mechas avançados e conspirações militares, misturando ação intensa, comédia e romance.