Em "Blue Gender", Yuji Kaido é diagnosticado com uma doença misteriosa e criogenicamente congelado, acordando décadas depois em um mundo devastado por insetos gigantes conhecidos como Blue. Ele é resgatado por soldados da estação espacial Second Earth e juntos, lutam para sobreviver e retomar a Terra. A jornada de Yuji é tanto de sobrevivência quanto de descoberta, enquanto ele busca entender o propósito dos Blue, a verdade por trás da doença que o congelou e seu próprio lugar em um mundo transformado.