Em To LOVE Ru Darkness, Rito continua lidando com mal entendidos amorosos enquanto Lala, Haruna e as demais garotas complicam sua rotina. A história foca em Yami e sua irmã Mea, ligadas a uma organização sombria que deseja reativar a assassina conhecida como Arma Transformadora. Momo planeja criar um harém em torno de Rito, intensificando situações românticas e cômicas. Entre conflitos internos, batalhas e momentos picantes, Rito tenta proteger as garotas e manter a paz em sua vida escolar caótica.