Em uma pequena cidade japonesa, Mayuko é uma estudante pobre que vive em um velho alojamento e luta para pagar as contas. Sua rotina muda quando divide o quarto com NieA, uma alienígena desajustada e preguiçosa que vive quebrando coisas e criando confusão. Enquanto humanos e alienígenas convivem de forma tensa e indiferente, Mayuko tenta encontrar um propósito em meio à monotonia e às dificuldades financeiras. A convivência com NieA revela conflitos sociais, solidão e sonhos frustrados, mas também momentos de humor e afeto em uma vida simples e aparentemente sem rumo.