Em um Japão feudal dominado por alienígenas, o samurai preguiçoso Gintoki Sakata trabalha como faz tudo ao lado de Shinpachi e Kagura. Juntos aceitam qualquer serviço por dinheiro e se metem em confusões absurdas que misturam comédia escrachada ação intensa e paródias de outros animes. Enquanto enfrentam vilões perigosos e situações ridículas o passado de Gintoki e os conflitos entre samurais e invasores vão sendo revelados trazendo momentos emocionantes em meio ao humor caótico.