Excel Saga acompanha Excel, uma agente hiperativa da misteriosa organização ACROSS, que deseja conquistar a cidade e depois o mundo. Ao lado da silenciosa Hyatt e de um cão falante chamado Menchi, ela se envolve em missões absurdas que parodiam diversos gêneros de anime e cultura pop. Cada episódio muda de estilo e exagera clichês com humor caótico e referências rápidas.