Koyomi é uma garota desajeitada que decide aprender magia moderna com a poderosa e preguiçosa Misa. Nesse mundo a magia funciona como programação de computadores e feitiços são como códigos. Enquanto Koyomi tenta dominar até os truques mais simples acaba envolvida em incidentes perigosos com magos talentosos artefatos misteriosos e experimentos fora de controle. Entre aulas caóticas explosões inesperadas e amizades improváveis ela descobre seu próprio potencial mágico.