Em Ikkitousen: Great Guardians, Hakufu Sonsaku retorna ao cotidiano escolar após batalhas intensas, mas a paz é abalada pela chegada inesperada de uma garota que afirma ser sua irmã mais nova. Enquanto tenta lidar com essa nova relação, rivalidades entre escolas ressurgem e antigos inimigos voltam à cena. Conspirações envolvendo os magatamas colocam em risco o equilíbrio entre os guerreiros. Entre lutas explosivas, comédia e fanservice, Hakufu precisa proteger seus amigos e descobrir a verdade por trás do misterioso passado que conecta todos os combatentes.