Em Transformers: Robot Masters, Autobots e Decepticons travam novas batalhas quando misteriosos Robot Masters surgem de diferentes eras. Convocados por uma distorção temporal, heróis como Optimus Prime e vilões como Megatron enfrentam versões alternativas de si mesmos e novos guerreiros mecânicos. Em meio a conflitos pela energia e pelo controle do tempo, alianças improváveis se formam e antigos segredos são revelados.