Lloyd Irving e seus amigos acompanham Colette em sua jornada de regeneração do mundo de Sylvarant, ameaçado pela escassez de mana. Enquanto enfrentam monstros e os cruéis Desians, o grupo descobre segredos sombrios sobre o verdadeiro propósito da missão de Colette e o preço que ela deve pagar. Divididos entre salvar Sylvarant e proteger a amiga, eles questionam profecias, deuses e o próprio destino, iniciando uma luta pela liberdade de todos os mundos.