Em Geobreeders: File X Chibi Neko Dakkan a equipe Kagura Total Security é contratada para resgatar uma misteriosa garota gato raptada por criaturas sobrenaturais conhecidas como Nekomata. Em meio a perseguições explosões e tiroteios a desorganizada equipe de agentes precisa enfrentar inimigos invisíveis e situações caóticas enquanto tenta proteger a pequena Nekomata. A missão rapidamente foge do controle revelando conspirações e segredos sobre a verdadeira natureza desses seres felinos e o passado da própria organização.