Em um futuro sombrio, o lendário pirata espacial Captain Herlock retorna após anos desaparecido, quando uma ameaça ancestral desperta nas profundezas do universo. A Terra enfrenta forças sobrenaturais ligadas a um enigma cósmico, e apenas Herlock e sua tripulação da Arcadia podem impedir a destruição total. Enquanto confronta velhos aliados, inimigos e fantasmas do passado, Herlock desafia governos corruptos e entidades de outro mundo em uma jornada melancólica, repleta de batalhas espaciais, mistérios existenciais e sacrifícios, buscando preservar a liberdade humana diante de um destino inevitável.