Ichika Orimura é o único homem capaz de pilotar o poderoso exoesqueleto IS e estuda em uma academia dominada por garotas. Em Encore Koi ni Kogareru Rokujuusou o clima é mais leve e romântico, focando no dia a dia após os eventos principais. As heroínas disputam a atenção de Ichika em situações cômicas e embaraçosas enquanto fortalecem laços e rivalidades. Entre mal entendidos encontros e momentos íntimos cada personagem tenta expressar seus sentimentos por ele.