Na segunda temporada de Nanbaka, os quatro detentos mais problemáticos da Prisão 13 continuam causando confusão enquanto segredos sombrios da instituição vêm à tona. Jyugo enfrenta seu passado misterioso e as estranhas algemas em seu corpo, enquanto novos inimigos surgem dentro e fora da prisão. Entre comédia exagerada, lutas intensas e situações absurdas, guardas e prisioneiros se veem obrigados a cooperar para sobreviver a ameaças inesperadas que podem mudar para sempre o destino da prisão.