Em uma cidade subterrânea envolta em névoa roxa, o detetive Sōtarō investiga desaparecimentos misteriosos ligados a um trem fantasma. Durante o caso, ele conhece Tanne, enigmática comandante de um trem blindado que patrulha os túneis. Juntos, eles enfrentam conspirações, criaturas estranhas e segredos enterrados nas profundezas da metrópole. Enquanto a linha entre realidade e fantasia se desfaz, Sōtarō precisa descobrir a verdade por trás da névoa e do passado de Tanne antes que a cidade seja consumida pela escuridão.