Em Soukyuu no Fafner: Dead Aggressor The Beyond Part 2 a luta pela sobrevivência da humanidade se intensifica quando novos inimigos e mistérios surgem em torno dos Festum. Enquanto a ilha Tatsumiyajima enfrenta ameaças externas e conflitos internos, jovens pilotos precisam lidar com perdas, sacrifícios e revelações sobre o verdadeiro papel dos Fafners. A esperança de coexistência é colocada à prova em batalhas cada vez mais desesperadas.
