Dez anos após a derrota do cientista maligno Dr. Hell, Koji Kabuto e seus amigos se deparam com uma nova ameaça. Enquanto exploram as ruínas da base do Dr. Hell, eles descobrem o Mazinger Z Infinity, uma nova versão do robô, enterrado perto do Monte Fuji. A descoberta desencadeia uma série de eventos que ameaçam a humanidade, forçando Koji a tomar uma decisão crítica sobre seu destino e o do mundo, enquanto enfrenta um inimigo poderoso que deseja o fim da humanidade.