Em meio a um Japão devastado pelos Kabanes, Ikoma e Mumei seguem viagem a bordo do Koutetsujou, enfrentando novas ameaças humanas e monstruosas. Enquanto uma misteriosa força inimiga surge, alianças são testadas e segredos do passado vêm à tona. A luta pela sobrevivência exige sacrifícios dolorosos, e o grupo precisa decidir em quem confiar para proteger o que resta de esperança.