Em um sufocante dia de verão, Shintaro Kisaragi, um hikikomori obcecado por computadores, vê sua rotina ruir quando um vírus em forma de garota surge em sua tela. Forçado a sair de casa pela primeira vez em anos, ele cruza o caminho de um grupo de jovens com estranhos poderes ligados a seus olhos. Entre encontros caóticos, segredos do passado e um misterioso incidente, todos se veem presos em um ciclo de acontecimentos que desafia a lógica do tempo e da realidade.