Anna é uma menina solitária que passa as férias em uma vila litorânea para melhorar sua saúde. Lá ela descobre uma misteriosa mansão perto do pântano e conhece Marnie, uma garota enigmática com quem cria um laço profundo. Conforme as duas se aproximam, segredos do passado vêm à tona e Anna começa a entender sua própria história e sentimentos. Entre memórias, sonhos e realidade, a amizade das duas transforma a forma como Anna vê a si mesma e o mundo ao seu redor.