Afro Samurai: Resurrection acompanha Afro após conquistar vingança e viver em aparente paz. Sua tranquilidade é destruída quando Sio surge para puni-lo pelos pecados do passado e rouba a faixa número um junto com a cabeça de seu pai. Forçado a retornar ao caminho da violência, Afro precisa enfrentar antigos inimigos e novos desafios em uma jornada sangrenta para recuperar o que perdeu e confrontar as consequências de suas escolhas.