O ano é 21XX. Os reploides são comuns agora, depois que o Dr. Cain redescobriu o antigo laboratório do Dr. Light e baseou vários desenhos do original do Dr.Light, chamado "Megaman X". X, entretanto, juntou-se aos Maverick Hunters e trabalha com o líder da unidade Zero sob o comando da General Sigma. O trabalho deles é acabar com os reploides desonestos, aqueles que se tornaram violentos. (Fonte: ANN)(Auto Tradução / Temporário)